技术研发
鹍远OncoAim®全景基因检测，助力肺癌精准治疗
肺癌是中国最常见的癌症，其中，非小细胞肺癌占所有肺癌的80%-85%，肺腺癌是主要亚型[1, 2]。近年来，靶向治疗大大延长了携带靶向突变的非小细胞肺癌患者的生存期[3]。此外，免疫检查点抑制剂的应用（ICIs）也显著提高了总生存率（OS）[4]。NGS技术的发展有助于挖掘肺癌更多分子特征，帮助患者选择个性化靶向治疗或免疫治疗。鹍远生物通过与临床专家深入合作，不断升级NGS技术，致力于为肺癌患者个性化治疗决策提供助力。
上海复旦大学附属中山医院呼吸与危重症医学科李春医生与鹍远生物合作，利用鹍远生物OncoAim®全景基因检测，绘制了101例肺腺癌患者的分子突变图谱。根据OncoKB的证据，70%的患者发生至少一种靶向药相关突变，其中，41.6%的患者有FDA推荐药物的1级突变证据，靶向治疗不仅成为这部分患者的首要选择且显著改善了患者的预后。本队列中的高频突变基因，CEBPA，与EGFR-TKIs的治疗疗效相关；ERBB2、CEBPA和TCF7L2突变状态和TMB密切相关，提示了它们作为靶向治疗和免疫治疗的分子标志物的可能性，以上研究结果发表在《Frontiers in Oncology》杂志上[5]。
患者入组及分析流程
NGS分析101名LUAD患者的常见和不常见的突变，共有71名患者在组织中检测到靶向药相关突变，其中35名患者接受了靶向治疗。有32名有随访信息的患者，他们接受了靶向药物疗效评估（图1）。
图1 | 患者分析流程图
结果简述
最常见的突变基因是EGFR（53%，54/101）和TP53（32%，32/101），其他突变频率高的基因分别为ERBB2（25%，25/101）、ATR（20%）、CEBPA（16%）、RB1（16%）、TCF7L2（14%）、ROS1（12%）和SPTA1（12%）。其中，ERBB2、ATR、CEBPA、RB1和TCF7L2基因的突变频率显著高于TCGA和ICGC数据库中报道的突变频率（图2）。
图2 | 101例中国LUAD患者的突变图谱
在101例患者中，71例（70.3%）存在靶向突变，根据OncoKB证据，建议进行靶向治疗。此外，41.6%的患者有FDA推荐药物相关的1级突变证据（表1），且靶向治疗已成为这些患者的首选治疗手段。在随访的36名患者中，32名使用匹配靶向药物的患者的中位缓解期>14个月，高于未使用靶向药的患者。此外，在29.7%的没有靶向药相关突变的患者中，CEBPA、RB1、TCF7L2是最常见的突变基因，为研究和开发新的靶向药物提供了潜在的靶点。
CEBPA突变常见于EGFR-TKIs响应时间短（<14个月）的患者中（P=0.031）。有CEBPA突变的患者对TKIs的响应持续时间比没有CEBPA突变的患者短（12个月vs.18个月）（图3）。
图3 | 突变基因对EGFR-TKIs疗效的影响
结论
肺腺癌是一种高度异质性的疾病，在不同人群中的基因型不同，而驱动基因的差异，会影响靶向药物的疗效。本研究绘制了中国东部地区肺腺癌患者的突变图谱，探索中国人特有的突变基因在靶向药治疗中的应用价值。鹍远生物OncoAim®全景基因检测不仅有助于帮助临床寻找到更多变异信息，指导靶向药和免疫药物精准治疗，同时利用DNA测序结果预测EGFR-TKIs靶向治疗的效果，为临床治疗策略的全程管理提供了理论基础。
参考文献：
[1] Siegel, R.; Ma, J.; Zou, Z.; Jemal, A. Cancer statistics, 2014, CA Cancer J Clin. 2014, 64, 9-29.
[2] Feng, R. M.; Zong, Y. N.; Cao, S. M.; Xu, R. H. Current cancer situation in China: good or bad news from the 2018 Global Cancer Statistics?, Cancer Commun (Lond). 2019, 39, 22.
[3] Clinical Lung Cancer Genome, P.; Network Genomic, M. A genomics-based classification of human lung tumors, Sci Transl Med. 2013, 5, 209ra153.
[4] Reck, M.; Rodriguez-Abreu, D.; Robinson, A. G., et al. Pembrolizumab versus Chemotherapy for PD-L1-Positive Non-Small-Cell Lung Cancer, N Engl J Med. 2016, 375, 1823-1833.
[5] Jie Liu, Wang-yang Xu , Maosong Ye , Zilong Liu, Chun Li. Front. Oncol. 2021, 14.
